位於切頭山聖地內的切頭山殉教博物館,於1967年10月落成。原名為切頭山殉教紀念館,2000年11月更名為切頭山殉教博物館。博物館內收藏有天主教的相關資料、古物等。分別有書籍類1258本、教會史方面的古物750個、民俗陶瓷器186個、民俗藝品151個、繪畫155幅、室外展示品45個等,共3000多種歷史性古物。其中最令人矚目的是,義大利傳教士利馬竇(Matteo Ricci)用中文所著天主教教理《天主實義》,這本書籍在天主教的歷史中,具有相當重要的地位。
室外展覽場中,則立有在天主教史上具有重要性的代表人物銅像,和相關物品。例如,藏有聖母瑪莉亞像的聖母穴、和韓國第一位神父金大建的銅像等。博物館的所在地“切頭山聖地”的由來,1866年丙寅迫害(大規模迫害天主教徒事件)時,無數的教徒在此地被殺害,因此切頭山成為天主教的殉教聖地。